از سال ١٣٦١ هجرى ، آن هنگامى که ضریح کنونى امیر المومنین ع ازسوى بهره هاى داوودى هند که به دستور طاهر سیف الدین امام بهره هاى آن دوران ساخته شده ودر این مکان مقدس نصب گردید ، تغییرى در درون ضریح وکف پیرامون صندوق خاتمى که بر روى قبر مطهر حضرت قرار گرفته است ، صورت نگرفته بود.
در اقدامى که در این راستا تولیت آستانه علوى در نجف اشرف صورت داد ، عملیات تعویض سنگفرش پیرامون صندوق مطهر
ونیز صندوق شیشه اى که براى محافظت از صندوق خاتم روى مزار مبارک که تاریخ ساخت آن به سال ١١٩٨ هجرى ودوران زندیان باز مى گردد، را آغاز نمود.
در ابتداى این عملیات ، سنگهاى کف درونى ضریح مطهر که چندین دهه از آن سپرى شده وشکستگى وترک وجز اینها در آن بوجود آمده بود ، برداشته شده وبا سنگهاى مرمر سفید زیبایی که در حاشیه دوسوى آنها با سنگهاى عقیق سبز وقرمز
در درون مرمر نحت شده وباصطلاح جاگذارى شده است ،جایگزین گردید. 
درون ضریح مطهر پس از برداشته شدن صندوق شیشه اى قبلى وپوشانیدن صندوق خاتم ومحافظت از آن
سپس محافظ ویا صندوق شیشه اى که بر روى صندوق خاتم قرار داشت از آنجا که در چندین مکان این صندوق ، شیشه ترک برداشته وسه بخش از روى آن در بالاى صندوق شکسته شده بود که تاریخ آن نیز به دوران تولیت سید عباس کلیداربه سال ١٣٦١ هجرى باز مى گردید و از سویی فرسودگى چهارچوب آن که اثرى هنرى نیز نداشت ، با صندوق شیشه اى منحصر بفردى تغییر یافت.
شیشه جایگزین شده که در مجموع از چهارده قطعه ( شش قطعه در بالاسر وپایین پا وهشت قطعه در دوسوى دیگر) از ضخامت ٣٧ میلیمتر برخوردار بوده که ویژگى آن نخست مقاومت در برابر حریق تا چهارصد درجه به مدت یک ساعت را داشته واز سوى دیگر غیر قابل شکستن مى باشد.
وزن این صندوق شیشه اى در حدود هفت تن بوده که به وسیله چهارده پایه زمینى در پیرامون خود ودر زیر مرمر هاى یاد شده ،
نصب گردیده است.
فاصله بسیار اندک میان بخش هاى چهارده گانه شیشه ها را با نوارى همچون طناب در هم پیچیده شده که هر نوار خود از پنج طناب نازک به هم بافته شده، که نمودى از ( حبل الله المتین ) وپنج تن آل عبا مى باشد ، به رنگ طلایی آذین گردیده ، پوشانیده شده است.
در بخش فوقانى پیرامون این صندوق شیشه اى گرانسنگ ، چراغهاى ویژه اى به رنگ سبز وقرمز وآفتابى قرار داده شده است که در مراسم گوناگون اعیاد ویا شهادت ها ، مى توان با کنترل از راه دور ، از این چراغها بصورت تک رنگ ویا آمیخته باهم استفاده نمود. گفتنى است که صندوق خاتم موجود بر روى قبر مطهر حضرت ، که به بیش از دو قرن ونیم پیش باز مى گردد ، از تحفه هاى خاتم کارى شده زمان بشمار آمده وهر بخش از آن ، آیتى از جمال وزیبایی بشمار مى رود.
عملیات ترمیمى یاد شده ،هفده روز بطول انجامید ودوشنبه شب بیست وسوم مرداد سال ١٣٩٦ مطابق با بیست ویکم ذى القعده سال ١٤٣٨ هجرى به پایان رسید.
لازم به یاد آورى است که در این مدت یاد شده ، تنها حدود هفتاد سانتیمتر از پیرامون خارجى ضریح بوسیله صفحه هاى اکریلى که عکس ونور طبیعى ضریح مطهر بر آنها به چاب رسیده بود تا آنجا که افراد از دور نمى توانستند این تغییر را متوجه شده وخودرا پیرامون ضریح اصلى با شکل ورنگ خود نظاره گر بودند ، قرار داده شده بود.
پایان عملیات ترمیم وقرار داده شدن زنجیر نادرى در مکان خود در درون ضریح
سپس در دوشنبه شب یاد شده در مراسمى بسیار ساده ، ضریح مطهر به روى عاشقان باز گشایی گردید. این بازسازى وترمیم درونى ضریح مطهر امیر المومنین ع را به همه ولائیان آن حضرت ودودمان پاکش ، تبریک عرض مى کنیم.
اللهم وفقنا لخدمة امیر المومنین واولاده المعصومین علیهم السلام. آمین.