مژگان شجریان یک خرداد ۱۳۴۸ در تهران متولد شد. مژگان شجریان لیسانس موسیقی و نقاشی دارد و کارشناسی ارشدش را هم در رشته‌ی گرافیک گرفته است.

پدرش استاد محمدرضا شجریان خواننده ایرانی و مادرش فرخنده گل افشان می باشد.

مژگان شجریان دو خواهر بزرگتر بنام راحله و افسانه و یک برادر کوچکتر بنام همایون شجریان دارد و از ازدواج دوم پدرش یک برادر ناتنی بنام رایان دارد.

مژگان شجریان زیر نظر نوازندگان ممتاز ایرانی چون محمدرضا شجریان ، محمدرضا لطفی ، حسین علیزاده و پرویز مشکاتیان تعلیم دیده است.

مژگان راه پدر خود را ادامه داده است و اکنون تبدیل به یکی از بهترین نوازندگان و خوانندگان سنتی ایرانی شده اسـت. مژگان شجریان از سال 1389 نیز تکخوانی و هم آوازی را آغاز کرد.

مژگان شجریان شب گذشته استوری زیر را منتشر کرد.